ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России объявляет конкурс на замещение вакантных должностей

1.Заведующий лабораторией геномных исследований и вычислительной биологии
2. Научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики человека
3. Научный сотрудник лаборатории молекулярной патофизиологии

 

Заведующий лабораторией геномных исследований и вычислительной биологии

Отрасль – молекулярная биология и медицина.

Направление исследований.

1 Геномика
2 Транскриптомика
3 Метагеномика
4 Биоинформатика

Задачи

  • Организация и проведение исследований в области молекулярной медицины с акцентов на изучение роли природных биотопов человека
  • Организация сбора и хранения клинического материала и метаданных биомедицинских проектов
  • Развитие и реализация новых подходов накопления и анализа данных геномного и транскриптомного секвенирования
  • Разработка и реализация новых вычислительных алгоритмов комплексного анализа «больших данных»
  • Написание заявок на проектное финансирование (РНФ, РФФИ, МОН), обобщение научных результатов, подготовка отчетов и публикаций в рецензируемых научных изданиях
  • Научное руководство соискателями, аспирантами и студентами.
  • Координирование деятельности научного коллектива в процессе проведения исследования
  • Обоснование направления новых исследований и разработок

Методы

  • Аналитические - чтение научной литературы и формулировка задачи.
  • Управленческие - мотивация сотрудников к работе.
  • Организационные – создание условий для максимально продуктивной работы сотрудников.
  • Информатические - интеграция данных геномного/транскриптомного секвенирования и метаданных.
  • Дедукция и синтез при интерпретации полученных результатов и написании статей
  • Молекулярно-биологические - экстракция нуклеиновых кислот из биологического материала с последующим проведением геномного анализа и обработкой данных.

Публикации

  • по указанным выше направлениям исследований – не менее 20 публикаций за последние 5 лет.
  • Индекс Хирша – не менее 20

Прочие условия

1) участие в международных конференциях - не менее 10 за последние 10 лет.
2) наличие степени доктора наук с датой присуждения степени более 5 лет
3) опыт работы по специальности не менее 10 лет.
4) опыт руководства грантами (РНФ, РФФИ), Госконтрактами - не менее 5 за последнее 5 лет.

 

Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1а.

 

Срок подачи документов – с 21 февраля по 14 марта 2020 г. Дата проведения конкурса – 17 марта 2020 года.

Тел. (499) 246-91-65

E-mail: e.kostryukova@rcpcm.org

 

Научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики человека

Отрасль – молекулярная биология

Направление исследований - молекулярная генетика наследственных патологий роговицы

Задачи:

  1. Планирование новых проектов, ведение уже существующих, в том числе с установлением и поддержанием контактов с клиническими центрами и пациентскими сообществами, подготовка с нуля подробных протоколов по стандартам www.clinicaltrial.gov, в том числе для Локальных этических комитетов;
  2. Разработка структуры и поддержание баз участников, образцов (внесение клинико-патологических данных, деанонимизация, архивация, составление отчетов о статусе набора выборок);
  3. Реализация полного протокола подготовки образцов для анализа с использованием с высокопроизводительного секвенирования (Illumina HiSeq/MiSeq) от выделения ДНК/РНК до смешивания библиотек на запуск;
  4. Генерация идей и дизайн экспериментов для их реализации, как на основе анализа собственных данных, так и с использованием внешних данных, в том числе данных проектов dbGaP;
  5. Анализ сигнальных путей и процессов по результатам анализа дифференциальной экспрессии генов с последующей экспериментальной валидацией гипотез;
  6. Написание статей по теме исследования;
  7. Участие в написании заявок по грантам РНФ, РФФИ, Министерства науки и высшего образования РФ;
  8. Участие и руководство вышеперечисленными  грантами, а также государственными заданиями в сфере интересов ФМБА России;
  9. Руководство студентами и аспирантами для выполнения квалификационных (бакалаврских, магистерских и диссертационных) работ.

Методы

  1. Методы выделения ДНК, РНК из различного биологического материала (ткани, клетки);
  2. Конструирование библиотек (полногеномных, экзомных (амплификационные и гибридизационные), транскриптомных (поли-А и с рРНК-деплецией) библиотек, библиотек Т-клеточных рецепторов для высокопроизводительного секвенироваия на платформе Illumina (HiSeq/MiSeq);
  3. Методы работы с РНК в том числе, анализ качества РНК на приборе BioAnalyzer 2100 (Agilent), постановка различных вариантов обратной транскрипци, очистка поли-А РНК? деплеция рРНК.
  4. Дизайн с нуля компонентов ПЦР систем, постановка и интерпретация результатов, в том числе для ПЦР с конечной точкой (для фрагментного анализа коротких тандемных повторов, для последующего генотипирования вариантов ДНК с помощью секвенирования по Сэнгеру), ПЦР в реальном времени (с использованием интеркалирующих красителей, гидролизных проб в формате биплекса для анализа экспрессии генов и анализа копийности участка ДНК (copy number variation - CNV));
  5. Методы анализа метилирования ДНК (проведение реакции бисульфитной конверсии ДНК, дизайн праймеров и постановка метил-чувствительной ПЦР, в том числе методом анализа кривых плавления (MS-HRM));

Публикации – Не менее 3-х публикаций по теме исследования с индексацией в Scopus и Web of Science с использованием указанных методик для реализации поставленных задач.

Прочие условия - Опыт участия и руководства грантом (РНФ, РФФИ, Министерства науки). Знание английского языка на уровне, необходимом для написания статей в зарубежные журналы и выступления с устным докладом на конференции. Ученая степень кандидата наук.

Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1а.

 

Срок подачи документов – с 21 февраля по 14 марта 2020 г. Дата проведения конкурса – 17 марта 2020 года.

Тел. (499) 246-91-65

E-mail: e.kostryukova@rcpcm.org

 
 
Научный сотрудник лаборатории молекулярной патофизиологии

Отрасль – молекулярная биология

Направление исследований – разработка диагностических панелей метаболических маркеров для характеристики патофизиологических состояний при ВЗК

Задачи:

  1. Разработка протоколов пробоподготовки для анализа метаболитов методов ГХ-МС
  2. Разработка протоколов пробоподготовки для анализа метаболитов методов ЯМР
  3. Обработка и оптимизация получаемых методами ГХ-МС и ЯМР данных

Методы:

  1. Экстракция метаболитов из биологических образцов (сыворотка, стул, моча, клеточные лизаты)
  2. ГХ-МС
  3. ЯМР

Публикации – не менее 5 публикаций, с индексацией РИНЦ, Scopus и/или Web of Science с комплексным использованием указанных методик для реализации поставленных задач.