ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России объявляет конкурс на замещение вакантных должностей | ФНКЦ физико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина

Вакансия – младший научный сотрудник лаборатории геномных исследований и вычислительной биологии

Отрасль – биоинформатика
Направление исследований – метагеномика, медицинская информатика
Задачи – обработка NGS метагеномных данных, поиск ассоциаций композиции микробиома с клиническими признаками групп пациентов, создание предсказательных моделей, разработка и развитие цифровой инфраструктуры для проведения клинических исследований.
Навыки – уверенное владение языками программирования Python, JavaScript, R, инструментами командной строки, git, владение современными методами анализа метагеномных данных, методами статистики и машинного обучения, опыт разработки и развертки web-сервисов, опыт работы с базами данных PostgreSQL и neo4j.
Требования – высшее образование по профилю прикладная математика и информатика, опыт выступления на биоинформатических школах.
Публикации – не менее 2

Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1а.
Срок подачи документов – с 10 по 21 декабря 2020 г. Дата проведения конкурса – 22 декабря.
Тел. (499) 246-49-00
E-mail: e.kostryukova@rcpcm.org

Вакансия – младший научный сотрудник лаборатории геномных исследований и вычислительной биологии

Отрасль – биоинформатика
Направление исследований – метаболомика, сравнительная геномика
Задачи - обработка метаболомных данных, поиск низкомолекулярных маркеров, создание предсказательных моделей, разработка ПО для решения задач молекулярной биологии, обработка NGS данных. Методы — статистический анализ данных, программирование.
Навыки — уверенное владение Python и инструментами командной строки Linux, владение методами статистики и машинного обучения, знание специфики хроматографических методов и ЯМР, знание биохимии и молекулярной биологии, опыт разработки интерактивных web-приложений.
Требования – опыт выступления на научных конференциях, опыт выступления на биоинформатических школах.
Публикации – не менее 2

Вакансия – младший научный сотрудник лаборатории геномных исследований и вычислительной биологии

Отрасль – вычислительная биология
Направление исследований – метагеномика, метаболомика
Задачи – определение маркеров, значимо различающих заданные когорты; работа с существующими биоинформатическими пайплайнами и составление новых; анализ, чтение и написание научных статей; полный цикл разработки биоинформатических инструментов, включая их поддержку и публикацию на специализированных международных платформах, таких как bioconda, pypi; автоматизация процессов анализа данных.
Методы – статистика; анализ данных; программирование на языках R и Python; методы работы с композиционными данными (CoDa); машинное обучение; NGS; биоинформатические и метагеномные пайплайны.
Публикации – не менее 1.

Вакансия – младший научный сотрудник лаборатории лаборатории молекулярной патофизиологии

Отрасль – молекулярная биология
Направление исследований – Разработка протоколов выделения и ведения бактериальных культур из кишечных смывов и оптимизация протоколов исследования протеома единичной клетки
Задачи - отработка протоколов выделения бактериальных культур из кишечных смывов, отработка и оптимизация протоколов пробоподготовки протеома единичной клетки.
Методы - Ведение аэробных и анаэробных бактериальных культур. Пробоподготовка для протеомного исследования. Методы ВЭЖХ-МС.
Публикации – не менее одной публикации, с индексацией Scopus и/или Web of Science и/или РИНЦ с использованием указанных методик

Вакансия – младший научный сотрудник лаборатории лаборатории молекулярной патофизиологии

Отрасль – молекулярная биология
Направление исследований – Метаболомное профилирование низкомолекулярных соединений
Задачи - Подбор оптимальных условий пробоподготовки клинических образцов для исследования низкомолекулярных метаболитов. Подготовка и оценка профилей метаболитов для исследуемых патологий. Разработка методов количественного анализа метаболитов и валидации полученных данных.
Методы: Методы тушения и экстракции метаболитов метанолом и по методу Фолча. Методы ВЭЖХ-МС и ГХ-МС. Работа с базами данных метаболитов (HMDB, Lipid Maps и др.)
Публикации – не менее одной публикации, с индексацией Scopus и/или Web of Science и/или РИНЦ с использованием указанных методик

Вакансия – младший научный сотрудник лаборатории лаборатории прикладных биомедицинских микросистем

Отрасль – физика
Направление исследований – исследование электрофизических и оптических свойств микрофлюидных систем. Исследование микрорельефа структур и образцов.
Задачи – Разработка и оптимизация технологических процессов фабрикации микрофлюидных систем. Проектирование и разработка прототипов биомедицинских микросистем, детекторов и диагностических приборов. Исследование поверхности структур методами оптической и атомно-силовой микроскопии. Проведение исследований образцов методами рамановской спектроскопии. Проведение измерений электрофизических параметров структур.
Методы: четырехзондовый метод ван дер Пау, рамановская спектроскопия, плазмохимическое травление, магнетронное напыление, оптическая фотолитография, атомно-силовая спектроскопия, оптическая микроскопия.
Публикации – не менее одной публикации, с индексацией Scopus и/или Web of Science и/или РИНЦ с использованием указанных методик

Вакансия – младший научный сотрудник лаборатории лаборатории прикладных биомедицинских микросистем

Отрасль – химия
Направление исследований – Изучение модификации поверхности микрофлюидных устройств и способов химической пришивки молекул к поверхности биочипа.
Задачи – Разработка методов модификации поверхности. Оптимизация существующих методов модификации поверхности.
Методы: спектрофотометрия, жидкостное и плазменное травление, электрохимическое осаждение.
Публикации – не менее одной публикации, с индексацией Scopus и/или Web of Science и/или РИНЦ с использованием указанных методик

Вакансия – младший научный сотрудник лаборатории лаборатории прикладных биомедицинских микросистем

Отрасль – биофизика.
Направление исследований – Разработка и исследование микрофлюидных устройств и биосенсоров для прикроватной диагностики. Прототипирование медицинских биосенсоров.
Задачи – Отработка методов модификации поверхности (кремний, пластик, стекло, металл) для создания микрофлюидных устройств. Отработка методов работы с полимерными и композиционными материалами. Проведение технологических операций фотолитографии. Проведение измерений электрофизических и оптических параметров.
Методы: оптическая фотолитография, плазмохимическое травление, магнетронное напыление, Рамановская спектроскопия, флуоресцентная микроскопия.
Публикации – не менее одной публикации, с индексацией Scopus и/или Web of Science и/или РИНЦ с использованием указанных методик

Младший научный сотрудник лаборатории клеточной биологии – 4 вакансии

Отрасль – молекулярная и клеточная биология.
Направление исследований – изучение соматических клеток и органоидов, дифференцированных из плюрипотентных стволовых клеток носителей нейродегенеративных заболеваний.
Задачи – культивирование клеток человека, получение нокаутных линий, изучение их свойств in vitro и in vivo.
Методы: базовые методы молекулярной и клеточной биологии. Культивирование и анализ плюрипотентных стволовых клеток.
Публикации – не менее одной публикации, с индексацией Scopus и/или Web of Science и/или РИНЦ с использованием указанных методик