1. Заведующий лабораторией протеомного анализа
2. Научный сотрудник лаборатории молекулярной патофизиологии
3. Старший научный сотрудник лаборатории молекулярной медицины
4. Старший научный сотрудник лаборатории геномных исследований и вычислительной биологии
5. Младший научный сотрудник лаборатории системной биологии
Вакансия – заведующий лабораторией протеомного анализа
Отрасль – молекулярная биология
Направление исследований
геномное, транскриптомное и протеомное профилирование эукариот и бактерий.
Задачи:
- исследование молекулярных механизмов долговременной эпигенетической памяти адгезивно-инвазивной формы Escherichia coli от пациентов с болезнью Крона;
- исследование онкогенных свойств бактерий класса Mollicutes;
- разработка протеогеномных методов персонализированной диагностики и выбора метода лечения у пациентов с раком молочной железы.
Методы:
- геномные методы анализа (высокопроизводительное секвенирование с использованием платформ третьего и четвертого поколений, секвенирование по Сэнгеру; ПЦР);
- методы количественной транскриптомики (подготовка кДНК библиотек, нормализация кДНК, количественная ПЦР в реальном времени, сопряженная с обратной транскрипцией);
- методы количественной протеомики (двумерный дифференциальный гель-электрофорез, хромато-масс-спектрометрия (IDA, SWATH, MRM)), биоинформатические методы (de novo сборка геномов про- и эукариот, ресеквенирование эукартиотических геномов, аннотация и клиническая интерпретация для определения класса патогенности герминальных и соматических геномных вариантов человека, транскрипционный анализ с помощью пакетов EdgeR, SAJR);
- методы анализа белок-белковых и ДНК-белковых комплексов (голубой нативный гель-электрофорез, электрофоретическое торможение ДНК в геле).
Публикации
Публикации с индексацией в Scopus и Web of Science, в т.ч. по теме исследования.
Прочие условия
- Наличие ученой степени кандидата наук.
- Знание программ для анализа последовательностей ДНК (Snapgene, Ugene, Perlprimer).
- Владение языками программирования и навыками/инструментами IT-разработки (Git, bash, python, nextflow, Unix/Linux, Docker, Conda).
Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1 А.
Срок подачи документов – 31.10.2022 г.
Дата проведения конкурса – 02.11.2022 г.
Вакансия – научный сотрудник лаборатории молекулярной патофизиологии
Отрасль – молекулярная и клеточная биология
Направление исследований
Метаболомное профилирование низкомолекулярных соединений
Задачи:
- написание статей по теме исследования.
Методы:
- окрашивания;
- владение молекулярными методами: создание векторных конструкций, анализа нуклеиновых кислот (ПЦР, электрофорез, блот-гибридизация), ELISA (ИФА-анализ), Bio- Plex.;
- выделение нативных пептидов из микроорганизмов;
- методы генетической инженерии и клеточной селекции; культура in vitro, асептическая культура, бактериальные музеи.
Публикации
Не менее 10 публикаций в рецензируемых журналах.
Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1 А.
Срок подачи документов – 31.10.2022 г.
Дата проведения конкурса – 02.11.2022 г.
Вакансия – старший научный сотрудник лаборатории молекулярной медицины.
Отрасль – молекулярная биология
Направление исследований – изучение эффективности трансплантации фекальной микробиоты для коррекции физиологического состояния организма при различных нозологиях.
Задачи:
- разработка оптимального протокола подготовки биоматериала для фекальной трансплантации;
- анализ и интерпретация получаемых результатов;
- написание статей и грантов по теме исследования.
Методы:
- владение методами бактериологии (приготовление сред, посевы и идентификация микроорганизмов), газовой хроматографии и ВЖЭХ-МС/МС;
- умение работать с биологическим и клиническим материалом;
- знание основ иммуноферментного анализа, владение методом полимеразной цепной реакции и ПЦР в реальном времени.
Публикации
не менее 7 публикаций с индексацией РИНЦ, из них не менее 2 публикации по теме исследования
Прочие условия:
Наличие ученой степени кандидата наук.
Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1 А.
Срок подачи документов – 31.10.2022 г.
Дата проведения конкурса – 02.11.2022 г.
Вакансия – старший научный сотрудник лаборатории геномных исследований и вычислительной биологии
Отрасль – биоинформатика
Направление исследований – экология микробных сообществ человека
Задачи:
- работа с данными высокопроизводительного апликонного и метагеномного секвенирования;
- разработка математических методов для работы с данными высокопроизводительного секвенирования в контексте изучения микробных сообщества кишечника человека;
- построение биологических моделей и гипотез по результатам анализа метагеномных данных о вовлеченности микробиоты в здоровье человека; написание научный статей, подготовка статей к отправке в журнал, общение с редакциями зарубежных научных журналов, общение с рецензентами; ведение собственных проектов.
Методы:
- bash, R, python, snakemake; основные методы работы с данными высокопроизводительного секвенирования;
- методы анализа данных секвенирования 16S rRNA;
- таксономическая и функциональная аннотация метагеномов;
- сборка генов микроорганизмов с использованием метагеномных данных; визуализация метагеномных данных;
- анализ дифференциальной представленности;
- композиционный анализ данных (CoDa analysis);
- фреймворки для анализа метагеномных данных: Anvi’o, QIIME2, Assnake.
Публикации
- Не менее 10 публикаций в изданиях, индексируемых в Web of Science, Scopus.
- Наличие публикаций первым автором и автором для переписки
Прочие условия:
- Наличие степени кандидата биологических наук.
- Знание английского языка на уровне, необходимом для написания статей в зарубежные журналы.
Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1 А.
Срок подачи документов – 31.10.2022 г.
Дата проведения конкурса – 02.11.2022 г.
Вакансия – младший научный сотрудник лаборатории системной биологии
Отрасль – биоинформатика
Направление исследований – изучение опухолевой стромы и выявления ее значения в развитии канцерогенеза на основе комплексного анализа омиксных данных.
Задачи: анализ NGS данных в рамках выполнения научных проектов; написание статей по тематике исследования.
Методы:
- основные методы статистики, молекулярной биологии;
- программирование на R;
- владение биоинформатическими инструментами для анализа транскриптомных данных.
Публикации
- Не менее 1 публикации по тематике исследований.
Прочие условия:
- Наличие степени кандидата биологических наук.
- Знание английского языка на уровне, необходимом для написания статей в зарубежные журналы.
Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1 А.
Срок подачи документов – 09.12.2022 г.
Дата проведения конкурса – 12.12.2022 г.