ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России объявляет конкурс на замещение вакантных должностей

1. Младший научный сотрудник лаборатории клеточной биологии

Отрасль – математическая биология и биоинформатика.

Направление исследований – изучение влияния микробиоты кишечника на развитие нейродегенеративных заболеваний человека, изучение молекулярно-генетических механизмов наследственных заболеваний с использованием изогенных клеточных моделей на основе ИПСК.

Задачи – работа с данными массивного параллельного секвенирования, полученных на платформах Illumina и Oxford Nanopore; анализ биологических данных с помощью современных методов математики, математической статистики, машинного обучения и биоинформатики; написание статей по результатам исследований.

Методы – методы контроля качества секвенирования, включающие оценку качества прочтений и фильтрацию низкокачественных прочтений, например, FastQC, MultiQC, fastp, nanostat, porechop, chopper;
Методы для получения таблиц относительной представленности транскриптов при помощи сборки транскриптов de novo или картирования прочтений на референс, например, Trinity, STAR, HTSeq, StringTie;
Методы для анализа дифференциальной экспрессии генов, например, DESeq2, edgeR;
Методы анализа данных апликонного секвенирования, например, DADA2 или emu;
Методы анализа данных метагеномного секвенирования, включая таксономическую аннотацию, например, MetaPhlAn4, а также сборку геномов из метагеномов и получение таблиц представленностей геномов, например, MEGAHIT, MetaBAT2, Semibin2, DAS Tool, Checkm2, GTDB-Tk, inStrain;
Методы анализа дифференциальной представленности таксонов например Maaslin2, ZicoSeq, Songbird, Birdman.

Публикации – не менее 2-х публикаций за последние 5 лет.

Должностной оклад – 26 000 рублей.

Срок трудового договора – бессрочный, аттестация – по решению Конкурсной комиссии, не ранее 2 лет и не позднее 5 лет от момента подписания трудового договора.

Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1а.

Срок подачи документов – с 6 февраля по 6 апреля 2025 г. Дата проведения конкурса – 09 апреля 2025 года, 14.00.

Перечень документов можно запросить по указанному адресу электронной почты.

Телефон: +7 (499) 246-91-65
E-mail: e.kostryukova@rcpcm.org

Отрасль – Клеточная биология.

Направление исследований – Разработка клеточных моделей наследственных заболеваний человека на основе индуцированных плюрипотентных стволовых клеток и исследование патогенеза наследственных заболеваний на клеточном уровне. Валидация результатов in vitro экспериментов на моделях in vivo (грызуны).

Задачи – Получение, культивирование и характеристика линий индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК), несущих мутации, связанные с наследственными заболеваниями человека. Разработка протоколов направленной дифференцировки ИПСК в различные производные эктодермы, мезодермы и энтодермы. Планирование и осуществление экспериментов по изучению проявлений наследственных заболеваний в культуре дифференцированных производных. Руководство дипломными работами студентов лаборатории. Участие в организации, планировании и проведении экспериментов с лабораторными животными.

Методы – Работа с поисковой системой PubMed, библиографической базой данных Scopus, программой для управления библиографической информацией Mendeley, программным пакетом для статистического анализа GraphPad Prism, сервисами Nucleotide BLAST – NCBI, Primer-BLAST– NCBI, геномным браузером UCSC Genome Browser. Опыт работы с лабораторными животными (крысы, мыши), поведенческие тесты (открытое поле, приподнятый крестообразный лабиринт, принудительное плавание), экспериментальные модели депрессии (мягкий хронический непредсказуемый стресс, острое системное воспаление), получение и ведение первичных культур нейронов и глиальных клеток, а также других культур клеток млекопитающих, выделение различных отделов мозга лабораторных животных, получение плазмы и сыворотки крови человека и животных, иммуноферментный анализ, иммунофлуоресцентное окрашивание, количественное определение белка, электрофорез белков в полиакриламидном геле, идентификация белков с использованием метода Western blotting, выделение тотальной РНК, выделение ДНК, обработка экспериментальных проб ДНКазой I, проведение обратной транскрипции, полуколичественная ПЦР, Real Time ПЦР, идентификация полиморфизмов, агарозный гель-электрофорез ДНК, подбор праймеров, анализ результатов секвенирования по Сэнгеру.

Публикации – не менее 15 публикаций, не менее 3-х тезисов за последние 5 лет. Участие в грантах РНФ.

Дополнительные условия - наличие степени кандидата биологических наук.

Должностной оклад – 26 000 рублей.

Срок трудового договора – бессрочный, аттестация – по решению Конкурсной комиссии, не ранее 2 лет и не позднее 5 лет от момента подписания трудового договора.

Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1а.

Срок подачи документов – с 6 февраля по 26 февраля 2025 г. Дата проведения конкурса – 28 февраля 2025 года, 14.00.

Перечень документов можно запросить по указанному адресу электронной почты.

Телефон: +7 (499) 246-91-65
E-mail: e.kostryukova@rcpcm.org

Отрасль – Математическая биология и биоинформатика.

Направление исследований – Изучение влияния микробиоты кишечника на развитие нейродегенеративных заболеваний человека, изучение молекулярно-генетических механизмов наследственных заболеваний с использованием омиксных технологий и изогенных клеточных моделей на основе ИПСК.

Задачи – Работа с данными массивного параллельного секвенирования, полученных на платформах Illumina и Oxford Nanopore; анализ биологических данных с помощью современных методов математики, математической статистики, машинного обучения и биоинформатики. Планирование экспериментов и научно-организационное сопровождение НИР; написание отчетов по НИР; подготовка публикаций, в том числе и на английском языке; представление результатов на конференциях; подача заявок на грантовое финансирование; руководство малой научной группой, включающей аспирантов и студентов.

Методы – Методы контроля качества секвенирования, включающие оценку качества прочтений и фильтрацию низкокачественных прочтений, например, FastQC, MultiQC, fastp, nanostat, porechop, chopper;
Методы для получения таблиц относительной представленности транскриптов при помощи сборки транскриптов de novo или картирования прочтений на референс, например, Trinity, STAR, HTSeq, StringTie;
Методы для анализа дифференциальной экспрессии генов, например, DESeq2, edgeR;
Методы анализа данных апликонного секвенирования, например, DADA2 или emu;
Методы анализа данных метагеномного секвенирования, включая таксономическую аннотацию, например, MetaPhlAn4, а также сборку геномов из метагеномов и получение таблиц представленностей геномов, например, MEGAHIT, MetaBAT2, Semibin2, DAS Tool, Checkm2, GTDB-Tk, inStrain;
Методы анализа дифференциальной представленности таксонов например Maaslin2, ZicoSeq, Songbird, Birdman..

Публикации – Не менее 20-х публикаций за последние 5 лет.

Дополнительные условия – Кандидат должен обладать опытом руководства НИР, грантами РНФ или РФФИ.

Должностной оклад – 28 000 рублей.

Срок трудового договора – бессрочный, аттестация – по решению Конкурсной комиссии, не ранее 2 лет и не позднее 5 лет от момента подписания трудового договора.

Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1а.

Срок подачи документов – с 6 февраля по 26 февраля 2025 г. Дата проведения конкурса – 28 февраля 2025 года, 14.00.

Перечень документов можно запросить по указанному адресу электронной почты.

Телефон: +7 (499) 246-91-65
E-mail: e.kostryukova@rcpcm.org