Центр молекулярной медицины и диагностики

История отдела

1 декабря 2020 года в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России на базе Клинической больницы № 123 и научного подразделения создан Центр молекулярной медицины и диагностики (руководитель – к.б.н. Беспятых Ю.А.). Центр реализует стратегию трансляционной медицины – междисциплинарного направления, призванного сблизить фундаментальные научные наработки и практическую медицину. Основной целью является определение персонифицированного алгоритма оптимального комплексного лабораторного и инструментального исследования, а также совершенствование технологии диагностического процесса, внедрение в практику обоснованных и эффективных методов диагностики.

Выполняемые проекты

• Программа по долечиванию пациентов, перенёсших коронавирусную инфекцию
• Грант РНФ "Создание новых микрофлюидных биосенсоров для диагностики и типирования туберкулезной инфекции" (2020-2023)
• III фаза клинических испытаний вакцины «КовиВак» для профилактики новой коронавирусной инфекции
• Разработка комплексного подхода к ведению пациентов с Болезнью Крона
• Карта резистома для отделений реанимации ГКБ №52
• Определение показателей и корреляций значимых диагностических показателей методом иммуноферментного и хемилюминесцентного анализа
• Грант АНО «Московский центр инновационных технологий в здравоохранении» на тему «Трансплантация фекальной микробиоты у реципиентов аллогенной трансплантации костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток» (2022-2024)
• Поиск белковых биомаркеров, характеризующих тяжесть течения инфекции, вызываемой вирусом SARS-CoV-2

Последние публикации

• Zamakhaev M., Grigorov A., Bespyatykh J., Azhikina T., Goncharenko A., Shumkov M. VapC toxin switches M. smegmatis cells into dormancy through 23S rRNA cleavage. Arch Microbiol 205, 28 (2023). (https://doi.org/10.1007/s00203-022-03363-1)
• Господарик А.В., Улаханова Л.А., Есиев С.С., Полякова Е.В., Шанский Я.Д., Беспятых Ю.А. Роль генетических маркеров лекарственной устойчивости mef и ermB при подборе доноров фекальной микробиоты. Вестник РГМУ. 2022; (6): –. DOI: 10.24075/vrgmu.2022.059
• Р. Б. Городничев, М. А. Корниенко, Д. А. Беспятых, М. В. Малахова, В. А. Веселовский, О. В. Голощапов, А. Б. Чухловин, Ю. А. Беспятых, Е. А. Шитиков. Выделение и характеристика бактериофагов Klebsiella pneumoniae, кодирующих полисахарид-деполимеразы с уникальной капсульной специфичностью. Медицина экстремальных ситуаций, 2022, 04, DOI: 10.47183/mes.2022.038
• Shansky, Y.; Bespyatykh, J. Bile Acids: Physiological Activity and Perspectives of Using in Clinical and Laboratory Diagnostics. Molecules 2022, 27, 7830. (https://doi.org/10.3390/molecules27227830)
• Svetlova, J.; Gustin, D.; Manuvera, V.; Shirokov, D.; Shokina, V.; Prusakov, K.; Aldarov, K.; Kharlampieva, D.; Matyushkina, D.; Bespyatykh, J.; Anna Varizhuk; Vassili Lazarev; Tatiana Vedekhina. Microarray Profiling of Vaccination-Induced Antibody Responses to SARS-CoV-2 Variants of Interest and Concern. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 13220. (https://doi.org/10.3390/ijms232113220)
• Беспятых Ю.А, Господарик А.В., Шанский Я.Д. Особенности иммунного ответа у лиц, вакцинированных препаратом «КовиВак». Проблемы медицинской микологии, 2022, Т.24, №2, С. 48
• Ф. В. Ширшиков, Ю. А. Беспятых. ПЕТЛЕВАЯ ИЗОТЕРМИЧЕСКАЯ АМПЛИФИКАЦИЯ: ОТ ТЕОРИИ К ПРАКТИКЕ. БИООРГАНИЧЕСКАЯ ХИМИЯ, 2022, том 48, № 6, с. 677–693
• Elena Mikhalchik, Liliya Yu. Basyreva, Sergey A. Gusev, Oleg M. Panasenko, Dmitry V. Klinov, Nikolay A. Barinov, Olga V. Morozova, Alexander P. Moscalets, Liliya N. Maltseva, Lyubov Yu. Filatova, Evgeniy A. Pronkin, Julia A. Bespyatykh and Nadezhda G. Balabushevich. Activation of Neutrophils by Mucin–Vaterite Microparticles. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 10579. (https://doi.org/10.3390/ijms23181057)
• Ю. А. Беспятых, Д. В. Басманов. Омиксные технологии в диагностике Mycobacterium tuberculosis. Медицина экстремальных ситуаций, 2022, DOI: 10.47183/mes.2022.013
• Худжадзе Р.Т., Беспятых Ю.А. Особенности распространения респираторных вирусных инфекций в период пандемии COVID-19. Материалы XXVII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием. Лабораторная медицина: вклад в борьбу с пандемией. Сборник тезисов. Под редакцией В.В. Долгова. Москва, 2022. С. 139.
• Julia Galeeva, Vladislav Babenko, Ramiz Bakhtyev, Vladimir Baklaushev, Larisa Balykova, Pavel Bashkirov, Julia Bespyatykh et al. 16S rRNA gene sequencing data of the upper respiratory tract microbiome in the SARS-CoV-2 infected patients. Data in Brief 2022, 40 (15):107770 DOI: 10.1016/j.dib.2021.107770
• Sizova S, Shakurov R, Mitko T, Shirshikov F, Solovyeva D, Konopsky V, Alieva E, Klinov D, Bespyatykh J, Basmanov D. The Elaboration of Effective Coatings for Photonic Crystal Chips in Optical Biosensors. Polymers. 2022; 14(1):152. (https://doi.org/10.3390/polym14010152)
• Беспятых Ю.А., Худжадзе Р.Т. Особенности распространения респираторных вирусных инфекций в период пандемии COVID-9. Проблемы медицинской микологии, 2022, Т.24, №2, С. 48
• Шанский Я.Д., Комарова А.В., Беспятых Ю.А. Применение метода высокоэффективной жидкостной хроматографии в сочетании с тандемных масс–спектрометрией для мониторинга содержания желчных кислот и их конъюгатов в организме человека. Материалы научно-практических конференций в рамках VIII Российского конгресса лабораторной медицины (РКЛМ 2022): сборник тезисов. - ИПО «У Никитских ворот», 2022 – С. 37
• Господарик А.В., Мейдман Е.О., Шанский Я.Д., Беспятых Ю.А. Особенности иммунного ответа у лиц, вакцинированных препаратом «КовиВак». Материалы научно-практических конференций в рамках VIII Российского конгресса лабораторной медицины (РКЛМ 2022): сборник тезисов. - ИПО «У Никитских ворот», 2022 – С. 180
• Egor Shitikov, Dmitry Bespiatykh, Maja Malakhova, Julia Bespyatykh, Ivan Bodoev, Tatiana Vedekhina, Marina Zaychikova, Vladimir Veselovsky, Ksenia Klimina, Elena Ilina, Anna Varizhuk. Genome-wide transcriptional response of Mycobacterium smegmatis MC 2 155 to G-quadruplex ligands BRACO-19 and TMPyP. Frontiers in Microbiology 13:817024. doi: 10.3389/fmicb.2022.817024
• Babenko V., Bakhtyev R., Baklaushev V., Balykova L., Bashkirov P., Bespyatykh J., Blagonravova A., Boldyreva D., Fedorov D., Gafurov I., Gaifullina R., Galeeva J., Galova E., Gospodaryk A., Ilina E., Ivanov K., Kharlampieva D., Khromova P., Klimina K., Kolontarev K., Kolyshkina N., Koritsky A., Kuropatkin V., Lazarev V., Manolov A., Manuvera V., Matyushkina D., Morozov M., Moskaleva E., Musarova V., Ogarkov O., Orlova E., Pavlenko A., Petrova A., Pozhenko N., Pushkar D., Rumyantsev A., Rumyantsev S., Rumyantsev V., Rychkova L., Samoilov A., Shirokova I., Sinkov V., Solovieva S., Starikova E., Tikhonova P., Trifonova G., Troitsky A., Tulichev A., Udalov Y., Varizhuk A., Vasiliev A., Vereshchagin R., Veselovsky V., Volnukhin A., Yusubalieva G., Govorun V. ANALYSIS OF THE UPPER RESPIRATORY TRACT MICROBIOTA IN MILD AND SEVERE COVID-19 PATIENTS. Bioinformatics. 2021. С. 461025.
• Сорокина Е.А., Жгун Е.С., Кислун Ю.В., Денисова Е.А., Беспятых Ю.А., Ильина Е.Н. Оптимизация технологии получения препарата бактерий человека для биологической коррекции микрофлоры кишечника. Biomedical Chemistry: Research and Methods. 2021. Т. 4. № 2. С. e00151.
• Митько Т.В., Шакуров Р.И., Ширшиков Ф.В., Сизова С.В., Алиева Е.В., Конопский В.Н., Басманов Д.В., Беспятых Ю.А. Создание микрофлюидного биосенсора для диагностики и типирования Mycobacterium tuberculosis. Клиническая практика. 2021;12(2):14–20. doi: https://doi.org/10.17816/clinpract71815
• Басманов Д.В., Митько Т.В., Шакуров Р.И., Беспятых Ю.А. СОЗДАНИЕ НОВЫХ МИКРОФЛЮИДНЫХ БИОСЕНСОРОВ ДЛЯ МУЛЬТИПЛЕКСНОЙ ДЕТЕКЦИИ ПРОЦЕССА СВЯЗЫВАНИЯ ЛИГАНДОВ В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ Актуальные проблемы биомедицины – 2021: Материалы XXVII Всероссийской конференции молодых учёных с международным участием, Санкт-Петербург, 25-26 марта 2021 г. / Отв. ред. Т.Д. Власов. – СПб.: РИЦ ПСПбГМУ, 2021. – с.296 – ISBN 978-5-88999-717-7
• Bespyatykh J, Arapidi G, Shitikov E. Proteogenomic Approach for Mycobacterium tuberculosis Investigation. Methods Mol Biol. 2021;2259:191-201. doi: 10.1007/978-1-0716-1178-4_12. PMID: 33687716. (https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-0716-1178-4_12)
• Bespyatykh J, Bespiatykh D, Malakhova M, Klimina K, Bespyatykh A, Varizhuk A, Tevyashova A, Nikolenko T, Pozmogova G, Ilina E, Shitikov E. Aureolic Acid Group of Agents as Potential Antituberculosis Drugs. Antibiotics. 2020; 9(10):715. https://doi.org/10.3390/antibiotics9100715
• Bespyatykh J, Shitikov E, Bespiatykh D, Guliaev A, Klimina K, Veselovsky V, Arapidi G, Dogonadze M, Zhuravlev V, Ilina E, Govorun V. Metabolic Changes of Mycobacterium tuberculosis during the Anti-Tuberculosis Therapy. Pathogens. 2020; 9(2):131. https://doi.org/10.3390/pathogens9020131
• Shirshikov F. V. et al., 2019. MorphoCatcher: a multiple-alignment based web tool for target selection and designing taxon-specific primers in the loop-mediated isothermal amplification method. PeerJ, V. 7, e6801.
• Bespyatykh, J., Shitikov, E., Guliaev, A. et al. System OMICs analysis of Mycobacterium tuberculosis Beijing B0/W148 cluster. Sci Rep 9, 19255 (2019). https://doi.org/10.1038/s41598-019-55896-z
• Sizova S, Shakurov R, Mitko T, Shirshikov F, Solovyeva D, Konopsky V, Alieva E, Klinov D, Bespyatykh J, Basmanov D. The Elaboration of Effective Coatings for Photonic Crystal Chips in Optical Biosensors. Polymers. 2022; 14(1):152. https://www.mdpi.com/2073-4360/14/1/152
• Julia Galeeva, Vladislav Babenko, Ramiz Bakhtyev, Vladimir Baklaushev, Larisa Balykova, Pavel Bashkirov, Julia Bespyatykh et al. 16S rRNA gene sequencing data of the upper respiratory tract microbiome in the SARS-CoV-2 infected patients. Data in Brief 2022, 40 (15):107770 DOI: 10.1016/j.dib.2021.107770
• Ю. А. Беспятых, Д. В. Басманов. Омиксные технологии в диагностике Mycobacterium tuberculosis. Медицина экстремальных ситуаций, 2022, DOI: 10.47183/mes.2022.013
• Elena Mikhalchik, Liliya Yu. Basyreva, Sergey A. Gusev, Oleg M. Panasenko, Dmitry V. Klinov, Nikolay A. Barinov, Olga V. Morozova, Alexander P. Moscalets, Liliya N. Maltseva, Lyubov Yu. Filatova, Evgeniy A. Pronkin, Julia A. Bespyatykh and Nadezhda G. Balabushevich. Activation of Neutrophils by Mucin–Vaterite Microparticles. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 10579. https://www.mdpi.com/1422-0067/23/18/10579
• Ф. В. Ширшиков, Ю. А. Беспятых. ПЕТЛЕВАЯ ИЗОТЕРМИЧЕСКАЯ АМПЛИФИКАЦИЯ: ОТ ТЕОРИИ К ПРАКТИКЕ. БИООРГАНИЧЕСКАЯ ХИМИЯ, 2022, том 48, № 6, с. 677–693
• Svetlova, J.; Gustin, D.; Manuvera, V.; Shirokov, D.; Shokina, V.; Prusakov, K.; Aldarov, K.; Kharlampieva, D.; Matyushkina, D.; Bespyatykh, J.; Anna Varizhuk; Vassili Lazarev; Tatiana Vedekhina. Microarray Profiling of Vaccination-Induced Antibody Responses to SARS-CoV-2 Variants of Interest and Concern. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 13220. https://www.mdpi.com/1422-0067/23/21/13220
• Shansky, Y.; Bespyatykh, J. Bile Acids: Physiological Activity and Perspectives of Using in Clinical and Laboratory Diagnostics. Molecules 2022, 27, 7830." target="_blank">https://www.mdpi.com/1420-3049/27/22/7830