Вчера, 25 января, в Институте молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН прошла защита докторской диссертации Егора Александровича ШИТИКОВА - руководителя лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов ФНКЦ ФХМ им Ю.М. Лопухина.
Тема диссертации: «Генетическая вариабельность микобактерий туберкулезного комплекса: роль в биологии, эпидемиологии и контроле»
Доктор биологических наук
Специальность: 1.5.3-молекулярная биология
Суть работы:
В работе представлен комплексный подход к изучению генетического разнообразия микобактерий туберкулезного комплекса (MTBC) для установления достоверной ассоциации между генетическими особенностями патогена и его фенотипическими признаками. Используя данные полногеномного секвенирования для более чем 15000 образцов MTBC и объединив воедино более 10 доступных классификаций, в ходе работы удалось разработать унифицированную номенклатуру патогена, включающую 169 линий и сублиний M. tuberculosis и M. africanum и 9 адаптированных к животным видов.
Соотнесение полученной классификации с крупными делециями генома и повторяющимися элементами IS6110 позволило раскрыть уникальные аспекты геномной организации микобактерий и связать их с фенотипическими проявлениями.
Применение классификации на представителях M. tuberculosis линии 2 позволило описать филогеографию популяции и разработать систему быстрой идентификации штаммов. В свою очередь использование байесовских подходов позволило на новом уровне исследовать структуру распространенного на территории России генотипа Beijing B0/W148, время зарождения изолятов и возникновения устойчивости к отдельным противотуберкулезным препаратам.
Также знание геномной организации позволило рассмотреть принципиально новый способ контроля инфекции, основанный на ингибирующем действии G4 стабилизирующих соединений BRACO-19 и TMPyP4.
Длительность исследования: с защиты кандидатской диссертации прошло: 10 лет, 15 публикаций и 25 конференций по теме исследования, переход из научного сотрудника в старшего научного, а потом в заведующего лабораторией и отделом. А если речь о написании текста, то... 2 месяца!
Научный консультант:
Д.б.н., член-корр. РАН, профессор РАН Ильина Елена Николаевна. Благодарим Елену Николаевну за долгие годы поддержки и руководства!
Поздравляем с успешной защитой докторской диссертации и желаем новых научных свершений!
В ближайшие дни Егор Александрович ШИТИКОВ ответит на наши вопросы, расскажет о том, насколько сегодня распространен туберкулез, в чем трудность лечения этой тяжелой болезни и как его исследования помогут в борьбе с недугом. Сегодня эта тема крайне актуальна в связи с широким распространением лекарственно устойчивых форм заболевания. Не пропустите!