В авторитетном научном журнале Nature Microbiology вышла статья по филогении вируса Кроссфага, обитающего в пищеварительном тракте человека. [R.A. Edwards et al. Global phylogeography and ancient evolution of the widespread human gut virus crAssphage. NatMicrobiol, 2019, https://doi.org/10.1038/s41564-019-0494-6, импакт-фактор 14,3.] Среди большой команды ученых, принимавших участие в исследовании, специалисты ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА России профессор РАН, д.б.н. Е.Н. Ильина и к.б.н. А.В. Тяхт, а также сотрудник НПФ «Литех» Е. Лисицына.
В ходе этого уникального проекта, объединившего 115 ученых из 65 стран под руководством профессора Роберта Эдвардса (RobertEdwards) из Университета Сан-Диего (США) и Басса Датилга (BassDutilh) из Центра молекулярной и биомолекулярной информатики Университет Неймегена имени святого Радбода Утрехтского (Нидерланды), ранее предсказавших существование Кроссфага (crAssphage) на основании метагеномных данных (DutilhB.E. etal. Unknown sequences in faecal metagenomes reveal a widely distributed and highly abundant bacteriophage. NatCommun, 2014, 5:4498, doi: 10.1038/ncomms5498), было показано, что этот крошечный вирус обитает в кишечнике людей во всех странах мира. Благодаря реализованным в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России проектам по метагеномному секвенированию кишечной микробиоты россиян удалось провести генотипирование представителей российской популяции этого вируса. Проведенное международное исследование позволило установить различия в структуре вирусного генома, характерные для разных стран, и тем самым понять, как эволюционирует микробиом кишечника человека.
Пока мы наблюдаем клональное распределение популяции вируса, в большей степени обусловленное географией выделения метагеномного образца. Поскольку выделить этот вирус в виде вирусного препарата получилось только в прошлом году, его роль в кишечном сообществе человечества еще предстоит оценить.