1. Младший научный сотрудник лаборатории геномных исследований и вычислительной биологии
2. Младший научный сотрудник лаборатории геномных исследований и вычислительной биологии
Отрасль – молекулярная биология.
Направление исследований: метагеномика природных сообществ.
Задачи – работа с ДНК и РНК, приготовление полногеномных и транскриптомных библиотек для высокопроизводительного сиквенирования. постановка сиквенирования, анализ данных, полученных после высокопроизводительного сиквенирования, написание статей по результатам исследований.
Методы – методы выделения ДНК, РНК из различного биологического материала, пробоподготовка образцов дальнейшего секвенирования, приготовление библиотек для различных секвенаторов (Illumina NextSeq/MiSeq, Oxford Nanopore Technologies), методы проведения различных вариантов полимеразной цепной реакции (ПЦР), включая ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ ПЦР) и ПЦР в реальном времени, электрофорез в агарозном геле.
Публикации – не менее 3-х публикаций, тезисов за последние 5 лет, опыт написания грантов.
Дополнительные условия – нет
Срок подачи документов – с 25 марта по 07 апреля 2024 г.
Дата проведения конкурса – 09 апреля 2024 года, 11.00.
Телефон: +7 (499) 246-91-65
E-mail: e.kostryukova@rcpcm.org
Отрасль – математическая биология и биоинформатика. Медицинская метагеномика.
Направление исследований: изучение разнообразия микробиоты кишечника и других биомов человека. Выявление связи бактериального разнообразия с различными заболеваниями человека и методами их терапии.
Задачи – работа с данными ампликонного и метагеномного секвенирования, анализ биологических данных с помощью современных методов математики, математической статистики, машинного обучения и биоинформатики биологических последовательностей, анализ данных секвенирования Illumina, Oxford Nanopore Technologies, написание статей по результатам исследований.
Методы – альфа-разнообразие, бета-разнообразие, визуализция данных при помощи языка R, применение методов машинного обучения (библиотеки Scikit-learn, PyTorch) для обработки биологических данных, автоматизация вычислений при помощи фреймворка snakemake, штаммовое профилирование с использованием программ SameStr, PStrain, InStrain, видовое профилирование при помощи MetaPhlAn, Kraken, анализ дифференциальной представленности бактерий - MaAsLin2, ANCOM-BC2, LEfSe, сборка MAGs с использованием Megahit, Metabat2, Maxbin2, DasTool, deep, GTDB-tk.
Публикации – не менее 2-х публикаций, тезисов за последние 5 лет. Участие в грантах РНФ.
Дополнительные условия – нет
Конкурс проводится в ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по адресу: Москва, ул. Малая Пироговская д.1а.
Срок подачи документов – с 25 марта по 07 апреля 2024 г.
Дата проведения конкурса – 09 апреля 2024 года, 11.00.
Телефон: +7 (499) 246-91-65
E-mail: e.kostryukova@rcpcm.org