Главная » Научные исследования » Отдел постгеномных технологий » Лаборатория молекулярной патофизиологии » Публикации
Лаборатория молекулярной патофизиологии

Публикации

Публикации лаборатории

  1. Внукова А.А., Колесникова И. В., Трошенкова А. Н., Силантьев А. С. Захаржевская Н.Б. Пробиотическая терапия воспалительных заболеваний кишечника посредством конкурентного ингибирования бактериального роста // XXVII Международная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2020». – Москва, 10–27 ноября 2020
  2. Трошенкова А.Н., Внукова А.А., Захаржевская Н.Б. Расчет коэффициента диагностической значимости метаболомного профилирования пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника // XXVII Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2020» Москва, 10–27 ноября 2020
  3. Кардонский Д.А., Силантьев А.С., Трошенкова А.Н., Конанов Д.Н. Внукова А.А., Колесникова И.В., Захаржевская Н.Б. Спектр легколетучих соединений при воспалительных заболеваниях кишечника // IV Конференция молодых ученых: Медико-биологические аспекты химической безопасности г. Санкт-Петербург, п. Рощино, Россия, 16–18 сентября 2020

Публикации сотрудников лаборатории

  1. Ivashkin, Vladimir; Maev, Igor; Trukhmanov, Alexander; Paraskevova, Ann; Lyamina, Svetlana; Kalish, Sergey; Pirogov, Sergey; Storonova, Olga; Ponomarev, Andrey; Rumyantseva, Diana; Sokolov, Kirill; Malyshev, Igor. Macrophage phenotype after human refluxate exposure, esophageal dysmotility and their correlation with gastroesophageal reflux disease. United European Gastroenterology Journal. In press. (manuscript ID is UEG-19-0436)
  2. Калиш С.В., Лямина С.В., Кузнецова Л.В., Буданова О.П., Логачев В.А., Пихлак А.Э., Малышев И.Ю. Антивоспалительный искусственно запрограммированный м3 фенотип макрофагов ограничивает кристалл-индуцированное подагрическое воспаление in vitro. Патогенез. 2020. Т. 18. № 2. С. 45-52. РИНЦ
  3. Калиш С.В., Лямина С.В., Кузнецова Л.В., Буданова О.П., Малышева Е.В., Говоров А.В., Прилепская Е.А., Пушкарь Д.Ю., Малышев И.Ю. М3 макрофаги останавливают деление клеток предстательной железы больного раком простаты Патологическая физиология и экспериментальная терапия. 2020. Т. 64. № 1. С. 54-59. РИНЦ SCOPUS
  4. Lyamina S., Kalish S., Malyshev I., Maev I. Immune response and macrophage phenotype regulation in gastroesophageal reflux disease with pulmonary manifestations. UEG Journal Vol 8 Issue 8 October 2020 – P. 150
  5. Малышев И.Ю., Калиш С.В., Лямина С.В., Шиманский Ш.Л., Суворова И.А., Кузнецова Л.В., Янушевич О.О. Cпособ подавления воспалительной реакции в тканях пародонта в эксперименте. Патент на изобретение RUS 2677642 01.12.2017, опубликовано 18.01.2019
  6. Paraskevova A., Trukhmanov A., Lyamina S., Kalish S., Storonova O., Pirogov S., Ponomarev A., Rumyantseva D., Sokolov K., Malyshev I., Maev I., Ivashkin V. The effect of different pH refluxate on the type of immune response in GERD patients. UEG Journal. Vol 7 Oct 2019; P709
  7. Lyamina S., Kalish S., Kladovikova O., Maev I., Malyshev I. Macrophage plasticity and polarization in different clinical variants of gastroesophageal reflux disease. UEG Journal. Vol 7 Oct 2019; P982
  8. Функциональная активность макрофагов при различных клинических вариантах гастроэзофагеальной рефлюксной болезни в зависимости от уровня ph рефлюктата Кладовикова О.В., Лямина С.В., Калиш С.В., Малышев И.Ю., Маев И.В. Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. 2019. № 2. С. 22-22.1. РИНЦ
  9. Renieri E.A., Goumenou M., Alegakis A., Tzatzarakis M.N., Tsatsakis A., Kardonsky D.A., Veselov V.V., Nosyrev A.E., Buha A., Rakitskii V.N., Kentouri M. Indicator PCBS in farmed and wild fish in greece - risk assessment for the greek population Food and Chemical Toxicology. 2019. Т. 127. С. 260-269.
  10. Zelenov V.V., Aparina E.V., Kozlovskiy V.I., Sulimenkov I.V., Kardonsky D.A., Nosyrev A.E. Solid products of no 3 uptake on methane soot Russian Journal of Physical Chemistry B. 2019. Т. 13. № 1. С. 219-224.
  11. Lyamina S., Maev I., Kalish S., et al. Features of the functional activity of macrophage link of immunity with gastroesophageal reflux disease depending on the type of reluctate: in vitro model. Ter Arkh. 2018; (2): 19-23 (in Russian) Scopus – включен
  12. Reatskaya A., Kalish S., Lyamina S., et al. In vitro reprogrammed МЗ macrophages stop devision of Erlich carcinoma in vivo. Patol Fiziol Eksp Ter. 2018; (1): 41-46 (in Russian) Scopus – включен
  13. Lyamina S, Kladovikova O, Kalish S, Maev I, Malyshev I. Macrophage functional activity changes in different clinical variants of gastroesophageal reflux disease depending on refluxate pH values. UEG journal October 2018; (Volume 6: Supplement 1): P A301 Scopus SJR 1.14
  14. Paraskevova А, Lyamina S, Kalish S, Storonova O, Pirogov S, Ponomarev A, Sokolov K, Rumyantseva D, Trukhmanov A, Malyshev I, Maev I, IvashkinI. Esophageal dysmotility and prevalence of expression CD25 marker in GERD patients. United European Gastroenterology Journal – October 2018: Vol.6 (8S): Suppl. 1– P. A512, P 1149 Scopus SJR 1.14
  15. Tuaeva N.O., Trukhan V.M., Kardonskii D.A., Eganov A.A., Grebenkina E.V., Veselov V.V. Preparation of low-molecular-weight heparins by radiation-induced destruction Pharmaceutical Chemistry Journal. 2018. Т. 52. № 2. С. 122-126
  16. Гребенкина Е.В., Гаврюшов С.А., Лисовская С.Б., Кардонский Д.А. Оценка диагностической эффективности предварительного иммунохроматографического анализа при проведении химико-токсикологических исследований на синтетические катиноны Медицина. 2018. Т. 6. № 3 (23). С. 140-152.
  17. Kalish S., Lyamina S., Manukhina E., et al. M3 Macrophages Stop Division of Tumor Cells In Vitro and Extend Survival of Mice with Ehrlich Ascites Carcinoma. Med Sci Monit Basic Res 2017; 23: 8-19 Scopus SJR 0.684
  18. Калиш С.В., Лямина С.В., Раецкая А.А., Буданова О.П., Малышев И.Ю. Программирование противоопухолевого иммунного ответа in vitro и его использование для остановки пролиферации опухолевых клеток и увеличения продолжительности жизни мышей с карциномой in vivo. Патологическая физиология и экспериментальная терапия. 2017. Т. 61. № 4. С. 67-73. Scopus WoS РИНЦ
  19. Лямина С.В., Калиш С.В., Рунова Г.С., Малышев И.Ю. Выделение мезенхимальных стволовых клеток из пульпы зуба и их характеристика. Современные проблемы науки и образования. 2017. № 5. С. 189. РИНЦ
  20. Lyamina S., Kalish S., Paraskevova A., et al. Gastroesophageal reflux disease patients refluxate type influence on macrophage phenotype. UEG journal October 2017; (Volume 5: Supplement 1) Scopus SJR 1.14
  21. Москалева Е.В., Ерощенко Н.Н., Кирюшин А.Н., Кардонский Д.А., Еганов А.А. Обнаружение α-пирролидиновалерофенона (α-pvp) и его метаболитов в объектах судебно-химического исследования. Судебно-медицинская экспертиза. 2017. Т. 60. № 1. С. 19-22.
  22. Zakharzhevskaya NB, Tsvetkov VB, Vanyushkina AA, Varizhuk AM, Rakitina DV, Podgorsky VV, Vishnyakov IE, Kharlampieva DD, Manuvera VA, Lisitsyn FV, Gushina EA, Lazarev VN, Govorun VM. Interaction of Bacteroides fragilis Toxin with Outer Membrane Vesicles Reveals New Mechanism of Its Secretion and Delivery.Front Cell Infect Microbiol. 2017 Jan 17;7:2. doi: 10.3389/fcimb.2017.00002.
  23. Zakharzhevskaya NB, Vanyushkina AA, Altukhov IA, Shavarda AL, Butenko IO, Rakitina DV, Nikitina AS, Manolov AI, Egorova AN, Kulikov EE, Vishnyakov IE, Fisunov GY, Govorun VM. Outer membrane vesicles secreted by pathogenic and nonpathogenic Bacteroides fragilis represent different metabolic activities.Sci Rep. 2017 Jul 10;7(1):5008. doi: 10.1038/s41598-017-05264-6.
  24. Lyamina S., Kalish S., Paraskevova A., et al.. Macrophage functional activity depending on the refluxate type in gastroesophageal reflux disease. United European Gastroenterology Journal 2016; 4(5): 311 (P0445) Scopus SJR 1.14
  25. Lyamina N., Nalivaeva A., Schwarz Y., et al. PS 05-33 clinical and genetic factors and polymorphism of agt gene in young subjects with masked and stable arterial hypertention. Journal of Hypertension 2016; doi: 10.1097/01.hjh.0000500294.04251.40 Scopus SJR 1.73.
  26. Малышев И.Ю., Лямина С.В., Калиш С.В. Патент на изобретение № 2599545 от 06.11.2015. Способ подавления роста опухоли на основе in vitro репрограммирования макрофагов на М1 фенотип с повышенной способностью к продукции оксида азота в эксперименте. Опубликовано 10.10.2016 Бюл.№28
  27. Малышев И.Ю., Лямина С.В., Калиш С.В. Патент на изобретение № 2599438 от 06.11.2015. Способ подавления роста опухоли в эксперименте. Опубликовано 10.10.2016 Бюл.№28
  28. Кардонский Д.А., Еганов А.А., Москалева Е.В. Газохроматографическое определение вальпроата натрия в препаратах на основе наночастиц Фармация. 2016. Т. 65. № 5. С. 23-26.
  29. Бабалян К.А., Султанов Р., Генерозов Е.В., Захаржевская Н.Б., Шарова Е.И., Пешков М.Н., Васильев А.О., Говоров А.В., Пушкарь Д.Ю., Прилепская Е.А., Даниленко С.А., Бабикова Е.А., Ларин А.К., Говорун В.М. Полногеномный анализ метилирования ДНК при раке предстательной железы с использованием технологии Infinium Humanmethylation450 // Вопросы онкологии 2016.-N 1.-С.122-132
  30. Lyamina S., Kalish S., Yurenev G., et al. Surfactant protein D as additional marker in diagnostics of asthma and its combination with gastroesophageal reflux disease with pulmonary manifestations. European Respiratory Journal 2015; 46: PA3871 Scopus SJR 3.79
  31. Maev I, Lyamina S, Мalysheva E, et al. An immune response and an alveolar macrophage phenotype in asthma, gastroesophageal reflux disease and their concurrence. Ter Arkh. 2015; 87(3): 34-41 (in Russian - Маев И.В., Лямина С.В., Малышева Е.В., Юренев Г.Л., Малышев И.Ю. Иммунный ответ и фенотип альвеолярных макрофагов при бронхиальной астме, гастроэзофагеальной рефлюксной болезни и их сочетании. Терапевтический архив:Медицина, 2015. т.Том 87,N N 3.-С.34-41) ИФ РИНЦ 0,838 Scopus – включен
  32. Malyshev I., Lyamina S., Yurenev G., Maev I. Alveolar macrophages phenotype in patients with asthma and its combination with gastroesophageal reflux disease with pulmonary manifestations. European Respiratory Journal 2015; 46: PA377 Scopus SJR 3.79
  33. Чаусова С.В., Гуревич К.Г., Калиш С.В., Бондарева Г.П., Малышев И.Ю. Роль оксида азота в патогенезе непереносимости нестероидных противовоспалительных препаратов у больных с астматической триадой // Курский научно-практический вестник "Человек и его здоровье". 2015. № 2. С. 53-60.
  34. Kalish S., Lyamina S., Usanova E., et al. Macrophages Reprogrammed In Vitro Towards the M1 Phenotype and Activated with LPS Extend Lifespan of Mice with Ehrlich Ascites Carcinoma. Med Sci Monit Basic Res 2015; 21: 226-234 Scopus SJR 0.684
  35. Kalish S., Lyamina S., Chausova S., et al. C57BL/6N Mice Are More Resistant to Ehrlich Ascites Tumors Than C57BL/6J Mice: The Role of Macrophage Nitric Oxide. Med Sci Monit Basic Res 2015; 21: 235-40 Scopus SJR 0.684
  36. Lyamina S., Kalish S., Malyshev I. Macrophages reprogrammed in vitro towards M1 phenotype extend lifetime of mice with Ehrlich ascites carcinoma. J Biotechnol Biomater 2015; DOI: 10.4172/2155-952X.C1.046 Scopus SJR 0.929
  37. Rusinova GG, Vyazovskaya NS, Azizova TV, Revina VS, Glazkova IV, Generozov EV,Zakharzhevskaya NB, Guryanov MY, Belosokhov MV, Osovets SV. Molecular mechanisms of lung cancer development at its different stages in nuclear industry workers. Arkh Patol. 2015 Mar-Apr;77(2):10-5. Russian.
  38. Захаржевская Н.Б., Кулемин Н.А., Бабикова Е.А., Хомякова Е.Б., Генерозов Э.В. Фармакогенетические маркёры терапии колоректального рака. Новые подходы для оценки эффективности цитостатических препаратов. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии, 2015.-N 6.-С.67-76.
  39. Evsyutina Y., Trukhmanov A., Lyamina S., et al. The circulating level of cytokines in patients with different forms of gastroesophageal reflux disease: non-erosive reflux disease, erosive esophagitis and Berrett's esophagus. United European Gastroenterology Journal 2014; 2(1): A263 Scopus SJR 1.14
  40. Evsyutina Y., Trukhmanov A., Lyamina S., et al. The circulating level of cytokines in patients with refractory to proton pump inhibitors gastroesophageal reflux disease. United European Gastroenterology Journal 2014; 2(1): A264 Scopus SJR14
  41. Пшенникова М.Г., Бахтина Л.Ю., Калиш С.В., Буданова О.П., Малышев И.Ю.
    Роль генетических особенностей организма в устойчивости к опухолевым процессам у крыс линии август и популяции Вистар // Патологическая физиология и экспериментальная терапия. 2014.№ 2. С. 37-39.
  42. Gorokhova S., Generozov E., Atkov O., Muraseeva E., Naumov V., Babikova E., Zaharczevskaya N., Prigorovskaya T. Different Association of CRY1 and CLOCK Circadian Genes with Coronary Atherosclerosis. J Clin Exp Cardiolog, 2014, 5:6, doi:10.4172/2155-9880.1000317
  43. Viazovskaia NS, Rusinova GG, Azizova TV, Revina VS, Glazkova IV, Generozov EV, Zakharzhevskaia NB, Matushkina DS. Possibility of DNA isolation from archived autopsy tissues for molecular genetic studies. Arkh Patol. 2014 Mar-Apr;76(2):46-7. Russian.
  44. Naumov V, Gorokhova SG, Atkov OY, Muraseeva EV, Babikova EA, Generozov EV, Moroshkina SA, Zaharczevskaya NB. P324 * Circadian genes in the regulation of lipids in coronary artery disease. Cardiovascular Research 103(suppl 1):S58-S59; July 2014; DOI: 10.1093/cvr/cvu091.1
  45. Маев И.В., Лямина С.В., Калиш С.В., и др. Общее содержание и олигомерные трансформации сурфактантного белка D в бронхоальвеолярной лаважной жидкости при бронхиальной астме и гастроэзофагеальной рефлюксной болезни: роль в нарушении иммунного ответа. Клиническая медицина 2013; 91(4): 33-38 Scopus, SJR=0.11 [Maev I.V., Lyamina S.V., Kalish S.V., et al. Total level and oligomeric transformations of surfactant protein D in broncho-alveolar lavage fluid in bronchial asthma and gastroesophageal disease patients: role in immune response disorders. Klinicheskaya meditsina 2013; 91(4): 33-38 (in Russian)]
  46. Маев И.В., Лямина С.В., Калиш С.В., и др. Функциональная активность альвеолярных макрофагов у больных бронхиальной астмой и гастроэзофагеальной рефлюксной болезнью. Клиническая медицина 2013; 91(6): 41-47 Scopus, SJR=0.11 [Maev I.V., Lyamina S.V., Kalish S.V., et al. Functional activity of alveolar macrophages in bronchial asthma and gastroesophageal disease patients. Klinicheskaya meditsina 2013; 91(6): 41-47 (in Russian)]
  47. Lyamina S., Kalish S., Malyshev I. Surfactant protein D and its oligomeric forms in chronic obstructive pulmonary disease. ERJ 2013; 42(57): P4102 Scopus SJR 3.79
  48. Naumov VA, Generozov EV, Zaharjevskaya NB, Matushkina DS, Larin AK, Chernyshov SV, Alekseev MV, Shelygin YA, Govorun VM. Genome-scale analysis of DNA methylation in colorectal cancer using Infinium HumanMethylation450 BeadChips. Epigenetics. 2013 Sep;8(9):921-34. doi: 10.4161/epi.25577. Epub 2013 Jul 17.
  49. Khatkov IE, Kagramanova AV, Zakharzhevskaya NB, Babikova EA, Generozov EV, Shcherbakov PL, Parfenov AI. Current principles in the screening, diagnosis, and therapy of colorectal cancer. Ter Arkh. 2016;88(2):90-6. Review. Russian.