Федеральное государственное бюджетное учреждение «Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства» был создан Приказом Минздрава России от 07.07.2015 №424 на базе НИИ физико-химической медицины ФМБА России и Клинической больницы №123 ФМБА России. Сокращенное наименование учреждения — ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России.
Целью деятельности ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России является проведение биомедицинских исследований, получение новых знаний о механизмах патогенеза заболеваний человека, разработка и внедрение в медицинскую практику новых технологий профилактики, диагностики и лечения; создание алгоритмов персонифицированной медицины; оказание первичной медико-санитарной помощи, специализированной, в том числе высокотехнологичной, медицинской помощи работникам организаций отдельных отраслей промышленности с особо опасными условиями труда, в том числе имеющим профессиональные заболевания, и населению отдельных территорий, обслуживаемых ФМБА России, спортсменам спортивных сборных команд Российской Федерации; организация скорой медицинской помощи при возникновении чрезвычайных ситуаций на предприятиях, использующих в технологическом процессе физические, химические факторы и токсические вещества; оказание консультативно-диагностической помощи организациям, связанным в своей деятельности с использованием ядов и токсических веществ; оказание медицинской помощи гражданам Российской Федерации в рамках Территориальной программы Государственных гарантий бесплатного оказания гражданам медицинской помощи.
Основные направления научной деятельности ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России представлены в разделе «НАУКА». Информация по оказанию лечебно-профилактической помощи приведена в разделе «МЕДИЦИНА».
На базе ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России проходят обучение студенты медико-биологического факультета РНИМУ Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова (кафедры биохимии, биофизики, экспериментальной и теоретической химии), студенты факультета фундаментальной медицины Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (кафедра медицинской и биологической физики, курс оперативной хирургии), а также студенты факультета молекулярной и биологической физики Московского физико-технического института (кафедра молекулярной медицины).