- РНФ 22-15-00443 «Бактериофаги и антибиотики: путь к повышению эффективности терапии инфекций, вызванных Staphylococcus aureus», 2022-2025 гг.
- Госзадание ФМБА России «Разработка комплексной схемы терапии лекарственно-устойчивых возбудителей инфекционных заболеваний с применением бактериофагов или их производных в сочетании с антибактериальными препаратами» Шифр «Бактериофаг-2», 2022-2024 гг.
- РНФ 19-75-10109 «Геномные G-квадруплексы Mycobacterium tuberculosis как потенциальные мишени новых противотуберкулезных препаратов», 2020–2022 гг.
- НИР «Разработка персонализированного подхода терапии инфекционных процессов с применением вирулентных бактериофагов» Шифр «Бактериофаг», Госзадание ФМБА России (2019-2021)
- РФФИ 20-04-00686 «Применение методов глубокого машинного обучения в геномике Mycobacterium tuberculosis для создания открытой платформы по анализу эволюционных сигнатур патогена», 2020-2022 гг.
- Госзадание ФМБА России «Разработка персонализированного подхода терапии инфекционных процессов с применением вирулентных бактериофагов» Шифр «Бактериофаг», Госзадание ФМБА России, 2019-2021 гг.
- РФФИ 18-04-01035 «Исследование роли повторяющегося элемента IS6110 в микро- и макроэволюции Mycobacterium tuberculosis филогенетической линии 2», 2018–2019 гг.
- РФФИ 18-34-00168 «Протеогеномная характеристика Mycobacterium tuberculosis кластера Beijing B0/W148», 2018–2019 гг.
- РНФ 17-15-01412 «Системное исследование клональных групп Mycobacterium tuberculosis семейства Beijing, циркулирующих на территории РФ», 2017-2019 гг.
- РНФ 15-15-00158 «Поиск новых активаторов разрушения биопленок на основании протеомного анализа катетер-ассоциированных биопленок, образованных в условиях in vivo и in vitro», 2015–2017 гг.
- РФФИ 15-04-08158 «Расшифровка молекулярных механизмов проявления патогенности коагулазоотрицательными стафилококками», 2015–2017 гг.
- РНФ 14-15-00689 «Особенности спектра белков, экспрессируемых Mycobacterium tuberculosis кластера Beijing B0 в условиях in vitro и in vivo», 2014–2016 гг.
- Грант министерства образования и науки РФ «Разработка и выпуск опытных образцов тест-системы для обнаружения лекарственно-устойчивого туберкулеза с учетом особенностей геномной организации эндемичных для России штаммов», 2012–2013 гг.
- ФГУП НПО «Микроген» «Молекулярно-генетическое изучение вакцинного штамма Mycobacterium bovis BCG», 2013 г.